Guidobald von Thun und Hohenstein è stato un cardinale austriaco. Era membro di una nobile famiglia con origini italiane ed era figlio del conte Johann Siegmund von Thun und Hohenstein, governatore della Boemia, e della contessa Barbara von Thun und Hohenstein. Eletto arcivescovo di Salisburgo il 3 febbraio 1654 dal capitolo, venne preconizzato il 4 marzo di quello stesso anno ricevendo nel contempo il titolo di Primas Germaniae. Nominato commissario imperiale alla Dieta di Ratisbona del 1662, venne eletto proprio alla sede arcivescovile di Ratisbona dal 7 marzo 1666, dove morì il 1º giugno 1668 a causa di un'infezione del sangue causatagli da un piccolo taglio. Venne quindi sepolto di fronte all'altare della cappella di San Francesco nella cattedrale di Salisburgo